什麼時候應該採用藥物治療的方式，基本上可以以精神疾病三元素：生理、心理、社會三方面來做考量：
一、 生理方面：
若有失眠、恐慌症狀、壓力性身體疼痛（包括頭痛、背痛、肩頸酸痛、四肢疼痛、腸胃不適等）、食慾改變（厭食或暴食）、疲累或無活力、或血壓升高等症狀出現時，其都在顯示身體可能正在遭受壓力的破壞，特別是血壓升高可能會引起中風等不可回復性後遺症，此時就需要藥物治療來緩解壓力的破壞。
二、 心理方面：
若有坐立難安、易怒、思考力降低、注意力降低、自殺意念等症狀出現時，就需要考慮藥物治療。其實心理方面的嚴重度是一個非常主觀的感受，也就是患者本身的感受才是最重要的依據，有些比較內向的患者，或者是平常就比較會掩飾情緒的個案，外表可能看不出來其有什麼情緒困擾，但其內心卻已非常痛苦，特別是似乎快要失控的感覺時，就最好快點接受藥物治療，以免情況惡化。
三、 社會方面：
藥物治療在社會方面的治療目標，最重要的就是要避免「骨牌效應」，因此當患者出現「骨牌效應」時，藥物治療就必須要趕快介入，以免本來單一壓力源就已經快處理不來的情況，之後卻又增加更多的麻煩，阻絕到最後可能一發不可收拾的地步，特別是患者旁邊的親人，當患者出現「骨牌效應」的情況時，就應鼓勵患者就醫，以防情況持續惡化。
至於患者最關心的是何時能停藥，最簡單的原則就是壓力源消失，就可以慢慢地停藥，停藥的過程中由於需考慮到「成癮性」、「耐受性」、及「依賴性」的問題，因此患者不宜自己突然停藥，必須要遵循醫生的指示來減藥，而其具體做法如下：
一、有「成癮性」的藥物須要緩慢減藥，以防戒斷症狀產生，通常會建議患者先減一半劑量、另一半做為預備，一般是以七天為一週期，減得越慢戒斷症狀越少，一直到完全不使用為止，但若減量過程原來症狀復發，則需停止減量。
二、有心理「依賴性」問題者，可以用有需要時服用來處理，例如習慣吃安眠藥才能睡覺者，可能會因為沒有吃安眠藥而有心理障礙，其實只要將安眠藥放在床頭櫃上，先試著躺床看看能否自行入睡，若過半小時候還無法入睡時，再起來使用安眠藥即可，只要能成功自行入睡幾次後，自然有信心可以戒除掉心理「依賴性」，而能完全停藥。
三、若實在無法停藥或無法減量者，特別是過去創傷經歷無法釋懷，或是生理、安全、被接納的需求遲遲無法滿足，其完全停藥的可能性非常之低，如此則可以考慮以低「耐受性」的藥物取代高「耐受性」的藥物，例如以較低「耐受性」的鎮靜安眠類的藥物或有助眠效果的抗憂鬱劑，來取代高「耐受性」鎮靜安眠類的藥物，以免患者越吃越重。然而由於大部份的低「耐受性」藥物其作用都會較差，因此病患本身要有成效較差的心理準備，並且高度地配合才能成功地替換。
總之，在精神疾病的治療上，藥物治療扮演著非常重要的角色，醫師的專業加上患者正確的知識以及高度的配合意願，將可以使藥物治療發揮最大的效能，減少精神疾病對患者的傷害。
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